Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD3Q15054 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
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