Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NR1I3Q14994 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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