Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPNMBQ14956 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPNMBQ14956 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPNMBQ14956 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms