Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHD4Q14839 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CHD4Q14839 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CHD4Q14839 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
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