Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCD11Q14690 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDCD11Q14690 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.5 ms