Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
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GBX1Q14549 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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GBX1Q14549 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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GBX1Q14549 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GBX1Q14549 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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GBX1Q14549 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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GBX1Q14549 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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GBX1Q14549 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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GBX1Q14549 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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GBX1Q14549 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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GBX1Q14549 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GBX1Q14549 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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