Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RBM39Q14498 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
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