Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM29Q14134 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM29Q14134 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM29Q14134 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM29Q14134 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM29Q14134 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM29Q14134 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM29Q14134 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM29Q14134 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM29Q14134 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM29Q14134 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM29Q14134 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM29Q14134 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM29Q14134 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM29Q14134 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM29Q14134 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM29Q14134 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM29Q14134 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms