Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
COL9A2Q14055 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
COL9A2Q14055 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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