Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CKAP5Q14008 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CKAP5Q14008 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CKAP5Q14008 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CKAP5Q14008 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CKAP5Q14008 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CKAP5Q14008 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CKAP5Q14008 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CKAP5Q14008 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1
CKAP5Q14008 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP5Q14008 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP5Q14008 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CKAP5Q14008 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP5Q14008 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP5Q14008 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP5Q14008 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP5Q14008 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CKAP5Q14008 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP5Q14008 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP5Q14008 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CKAP5Q14008 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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