Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKP1Q13835 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PKP1Q13835 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
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