Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCOA4Q13772 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NCOA4Q13772 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
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