Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTCH1Q13635 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTCH1Q13635 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
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