Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MTMR3Q13615 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MTMR3Q13615 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR3Q13615 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR3Q13615 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR3Q13615 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MTMR3Q13615 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms