Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EIF4EBP1Q13541 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EIF4EBP1Q13541 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms