Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRPC3Q13507 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRPC3Q13507 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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