Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
TCIRG1Q13488 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
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