Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SP140Q13342 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP140Q13342 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP140Q13342 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP140Q13342 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP140Q13342 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP140Q13342 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP140Q13342 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP140Q13342 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP140Q13342 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP140Q13342 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP140Q13342 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP140Q13342 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP140Q13342 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SP140Q13342 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SP140Q13342 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SP140Q13342 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SP140Q13342 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SP140Q13342 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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SP140Q13342 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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SP140Q13342 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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SP140Q13342 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SP140Q13342 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SP140Q13342 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SP140Q13342 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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SP140Q13342 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SP140Q13342 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SP140Q13342 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SP140Q13342 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SP140Q13342 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SP140Q13342 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SP140Q13342 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SP140Q13342 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SP140Q13342 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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SP140Q13342 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SP140Q13342 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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SP140Q13342 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SP140Q13342 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SP140Q13342 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SP140Q13342 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SP140Q13342 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SP140Q13342 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SP140Q13342 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SP140Q13342 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP140Q13342 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SP140Q13342 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP140Q13342 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP140Q13342 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP140Q13342 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP140Q13342 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP140Q13342 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP140Q13342 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP140Q13342 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP140Q13342 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SP140Q13342 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP140Q13342 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SP140Q13342 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SP140Q13342 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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