Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CALCOCO2Q13137 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms