Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRIK3Q13003 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GRIK3Q13003 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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