Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNTN1Q12860 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN1Q12860 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN1Q12860 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN1Q12860 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN1Q12860 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNTN1Q12860 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN1Q12860 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN1Q12860 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN1Q12860 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN1Q12860 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN1Q12860 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN1Q12860 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN1Q12860 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN1Q12860 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN1Q12860 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN1Q12860 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN1Q12860 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN1Q12860 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNTN1Q12860 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNTN1Q12860 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN1Q12860 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN1Q12860 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN1Q12860 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNTN1Q12860 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNTN1Q12860 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CNTN1Q12860 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN1Q12860 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN1Q12860 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN1Q12860 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN1Q12860 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN1Q12860 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN1Q12860 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN1Q12860 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNTN1Q12860 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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