Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNH2Q12809 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNH2Q12809 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms