Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 DSS1YMR287C 2910 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 LRG1YDL240W 3054 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 FMP32YFL046W 624 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 TDA10YGR205W 873 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 BCD1YHR040W 1101 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 EPT1YHR123W 1176 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 MMF1YIL051C 438 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 SNX4YJL036W 1272 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 GLG2YJL137C 1143 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 EMC2YJR088C 879 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 YAL066WYAL066W 309 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 SAM37YMR060C 984 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 SRT1YMR101C 1032 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 IZH2YOL002C 954 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 BUD21YOR078W 645 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 MAK11YKL021C 1407 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 NDT80YHR124W 1884 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 LCB4YOR171C 1875 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 HDA2YDR295C 2025 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 CSR2YPR030W 3366 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 HSE1YHL002W 1359 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 AI4Q0065 1671 nt2.98□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 CPA2YJR109C 3357 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 YSP2YDR326C 4317 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 CDH1YGL003C 1701 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 SWD2YKL018W 990 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 YKL131WYKL131W 522 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 GTT2YLL060C 702 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 YLR366WYLR366W 306 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 RPL13BYMR142C 600 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 RAS1YOR101W 930 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 HAT1YPL001W 1125 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 YNR063WYNR063W 1824 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 TFB2YPL122C 1542 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 ECM18YDR125C 1362 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 ISW2YOR304W 3363 nt2.97□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 MSM1YGR171C 1728 nt2.96□□□□□ -1.93
HMS1Q12398 AUS1YOR011W 4185 nt2.96□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 PKH1YDR490C 2301 nt2.96□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 RRP42YDL111C 798 nt2.96□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 PSF1YDR013W 627 nt2.96□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 YGR114CYGR114C 390 nt2.96□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 PHD1YKL043W 1101 nt2.96□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 IMP4YNL075W 873 nt2.96□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 TPM1YNL079C 600 nt2.96□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 YNL226WYNL226W 411 nt2.96□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 GIS2YNL255C 462 nt2.96□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 THI80YOR143C 960 nt2.96□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 SHQ1YIL104C 1524 nt2.96□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 EXO5YBR163W 1758 nt2.96□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 CAF130YGR134W 3369 nt2.96□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 YAT2YER024W 2772 nt2.95□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 EMP70YLR083C 2004 nt2.95□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 TGL2YDR058C 981 nt2.95□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 RRP17YDR412W 708 nt2.95□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 YGL138CYGL138C 1038 nt2.95□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 YHR097CYHR097C 1101 nt2.95□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 SPC2YML055W 537 nt2.95□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 YOR062CYOR062C 807 nt2.95□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 SSM4YIL030C 3960 nt2.95□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 HUL5YGL141W 2733 nt2.94□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 THR4YCR053W 1545 nt2.94□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 MIG1YGL035C 1515 nt2.94□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 FRQ1YDR373W 573 nt2.94□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 APA2YDR530C 978 nt2.94□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 DOG1YHR044C 741 nt2.94□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 MRPL49YJL096W 486 nt2.94□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 MBR1YKL093W 1020 nt2.94□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 UBC12YLR306W 567 nt2.94□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 INN1YNL152W 1230 nt2.94□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 FIG1YBR040W 897 nt2.94□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 SRC1YML034W 2505 nt2.94□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 TSC11YER093C 4293 nt2.93□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 PTI1YGR156W 1278 nt2.93□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 SEC28YIL076W 891 nt2.93□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 RPS21AYKR057W 264 nt2.93□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt2.93□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt2.93□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 OCA2YNL056W 594 nt2.93□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 YNL319WYNL319W 441 nt2.93□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 AEP2YMR282C 1743 nt2.93□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 STU2YLR045C 2667 nt2.93□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 EXO70YJL085W 1872 nt2.92□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 CHA4YLR098C 1947 nt2.92□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 YEL010WYEL010W 351 nt2.92□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt2.92□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 COQ9YLR201C 783 nt2.92□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.92□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 GOT1YMR292W 417 nt2.92□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 YOR097CYOR097C 528 nt2.92□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 SFG1YOR315W 1041 nt2.92□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 SIZ1YDR409W 2715 nt2.91□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 BI3Q0115 1554 nt2.91□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 RUB1YDR139C 234 nt2.91□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 LIF1YGL090W 1266 nt2.91□□□□□ -1.94
HMS1Q12398 RPL24BYGR148C 468 nt2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.4 ms