Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 CPR7YJR032W 1182 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 STE18YJR086W 333 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 GAL7YBR018C 1101 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 RXT2YBR095C 1293 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YCL022CYCL022C 516 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 YLR152CYLR152C 1731 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 FAS2YPL231W 5664 nt3.78□□□□□ -1.8
LCB4Q12246 PIG2YIL045W 1617 nt3.77□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 PUB1YNL016W 1362 nt3.77□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 SLF1YDR515W 1344 nt3.77□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt3.77□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt3.77□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt3.77□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YPR148CYPR148C 1308 nt3.77□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YCL020WYCL020W 1317 nt3.77□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 WHI3YNL197C 1986 nt3.77□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YCR108CYCR108C 192 nt3.77□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 SPO73YER046W 432 nt3.77□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 GIM3YNL153C 390 nt3.77□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 TUM1YOR251C 915 nt3.77□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YPR172WYPR172W 603 nt3.77□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 ESA1YOR244W 1338 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 GCD1YOR260W 1737 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 MCM7YBR202W 2538 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 RPB2YOR151C 3675 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 RDS1YCR106W 2499 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YER077CYER077C 2067 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 BSC1YDL037C 987 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 MTC7YEL033W 420 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 PMI40YER003C 1290 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 ATG27YJL178C 816 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 AIM25YJR100C 984 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 SFT1YKL006C-A 294 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 OAR1YKL055C 837 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YKR011CYKR011C 1062 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 ECI1YLR284C 843 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 GMC2YLR445W 567 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 IRC21YMR073C 606 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 MFB1YDR219C 1398 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 VPS53YJL029C 2469 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 SLY41YOR307C 1362 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 DIP2YLR129W 2832 nt3.76□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 JEN1YKL217W 1851 nt3.75□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 SRP1YNL189W 1629 nt3.75□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 DIG2YDR480W 972 nt3.75□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YGR051CYGR051C 324 nt3.75□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YGR293CYGR293C 462 nt3.75□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YJR020WYJR020W 333 nt3.75□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YBR300CYBR300C 498 nt3.75□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 UBP12YJL197W 3765 nt3.75□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 SWH1YAR042W 3567 nt3.75□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 BCS1YDR375C 1371 nt3.75□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 TFB2YPL122C 1542 nt3.75□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 MNR2YKL064W 2910 nt3.74□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 KIN3YAR018C 1308 nt3.74□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 AAD3YCR107W 1092 nt3.74□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YER034WYER034W 558 nt3.74□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.74□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 RPB3YIL021W 957 nt3.74□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 IRC9YJL142C 393 nt3.74□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YMR087WYMR087W 855 nt3.74□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 RUF22RUF22 515 nt3.74□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt3.74□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YOR387CYOR387C 621 nt3.74□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 TCB3YML072C 4638 nt3.74□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 UBX3YDL091C 1368 nt3.74□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 GYP6YJL044C 1377 nt3.74□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 RPO31YOR116C 4383 nt3.74□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 PKP2YGL059W 1476 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YMR046CYMR046C 1323 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 MSM1YGR171C 1728 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 RSM28YDR494W 1086 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 GPP2YER062C 753 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YGL188CYGL188C 174 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 GIC1YHR061C 945 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 REC104YHR157W 549 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YKL202WYKL202W 582 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 ERP1YAR002C-A 660 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 IST1YNL265C 897 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YOR082CYOR082C 342 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YPL035CYPL035C 348 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 VPS17YOR132W 1656 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 SWI1YPL016W 3945 nt3.73□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 CDC45YLR103C 1953 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 SSM4YIL030C 3960 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 ALO1YML086C 1581 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 EPO1YMR124W 2832 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 ERJ5YFR041C 888 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 AML1YGR001C 747 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YGR126WYGR126W 693 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 RGI2YIL057C 495 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 RSM25YIL093C 795 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YJR141WYJR141W 1044 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 ATG10YLL042C 504 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.72□□□□□ -1.81
LCB4Q12246 YOR022CYOR022C 2148 nt3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.6 ms