Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	JSN1	YJR091C	3276 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	NHP10	YDL002C	612 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	TAN1	YGL232W	870 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	tQ(UUG)B	tQ(UUG)B	72 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	PPE1	YHR075C	1203 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	MAK16	YAL025C	921 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	ENV10	YLR065C	546 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	ARA1	YBR149W	1035 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	SIN4	YNL236W	2925 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	PSK1	YAL017W	4071 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	MSS4	YDR208W	2340 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	MDM1	YML104C	3384 nt		2.91	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	ECM29	YHL030W	5607 nt		2.9	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	STE24	YJR117W	1362 nt		2.9	□□□□□ -1.94
VIK1	Q12045	RIM1	YCR028C-A	408 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	TSC13	YDL015C	933 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	ARC19	YKL013C	516 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	CTL1	YMR180C	963 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YMR310C	YMR310C	954 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	IZH4	YOL101C	939 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	SYC1	YOR179C	567 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	RPS10A	YOR293W	318 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	MRP2	YPR166C	348 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YPR203W	YPR203W	309 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	KIN82	YCR091W	2163 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	VPS3	YDR495C	3036 nt		2.9	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	NTO1	YPR031W	2247 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YGR027W-B	YGR027W-B	5268 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YLR227W-B	YLR227W-B	5268 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YPR158C-D	YPR158C-D	5268 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	MSH2	YOL090W	2895 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	TGL2	YDR058C	981 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	NKP1	YDR383C	717 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	PMI40	YER003C	1290 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	PRP18	YGR006W	756 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YIR023C-A	YIR023C-A	324 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YKR011C	YKR011C	1062 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	GLO1	YML004C	981 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	DSS1	YMR287C	2910 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	PBI1	YPL272C	1554 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	RDS2	YPL133C	1341 nt		2.89	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	SAP1	YER047C	2694 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	SEC7	YDR170C	6030 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	RAD55	YDR076W	1221 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	GPP2	YER062C	753 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	FIP1	YJR093C	984 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YLR290C	YLR290C	834 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YLR297W	YLR297W	390 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	RIF2	YLR453C	1188 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	HNT3	YOR258W	654 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YPL035C	YPL035C	348 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	HRD1	YOL013C	1656 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YNR066C	YNR066C	1311 nt		2.88	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	SPP382	YLR424W	2127 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	NMD2	YHR077C	3270 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	SPT2	YER161C	1002 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	CDC26	YFR036W	375 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	PXR1	YGR280C	816 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YIL102C-A	YIL102C-A	228 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	GTT1	YIR038C	705 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	CSM3	YMR048W	954 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	RCE1	YMR274C	948 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YOR342C	YOR342C	960 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YBR116C	YBR116C	528 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	RPA190	YOR341W	4995 nt		2.87	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	BSC1	YDL037C	987 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	RRT13	YER066W	558 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YGL006W-A	YGL006W-A	111 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YHL005C	YHL005C	393 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	PAN5	YHR063C	1140 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	EMC2	YJR088C	879 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	RSM26	YJR101W	801 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YOL118C	YOL118C	309 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	ATG29	YPL166W	642 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YPR053C	YPR053C	456 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	KIN3	YAR018C	1308 nt		2.86	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YGR067C	YGR067C	2415 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	CIN1	YOR349W	3045 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	CIK1	YMR198W	1785 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YDR124W	YDR124W	975 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	TAM41	YGR046W	1158 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YGR168C	YGR168C	1131 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YGR190C	YGR190C	366 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	CFD1	YIL003W	882 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YJL175W	YJL175W	513 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YLR163W-A	YLR163W-A	114 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	NDL1	YLR254C	570 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	GSP1	YLR293C	660 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	DUG3	YNL191W	1074 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	ATP11	YNL315C	957 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	RPN8	YOR261C	1017 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	TFB6	YOR352W	1032 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	HFD1	YMR110C	1599 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	STE6	YKL209C	3873 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	EXO84	YBR102C	2262 nt		2.85	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	OPI6	YDL096C	327 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	RPS25A	YGR027C	327 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	LSM12	YHR121W	564 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	YIL024C	YIL024C	570 nt		2.84	□□□□□ -1.95
VIK1	Q12045	AAR2	YBL074C	1068 nt		2.84	□□□□□ -1.95

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