Protein–RNA interactions for Protein: Q12033

RIM20, pH-response regulator protein palA/RIM20, yeastyeast

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RIM20Q12033 RGI1YER067W 486 nt3.6□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 POL32YJR043C 1053 nt3.6□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 YLR169WYLR169W 354 nt3.6□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 GPN3YLR243W 819 nt3.6□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 RLP7YNL002C 969 nt3.6□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 PBP2YBR233W 1242 nt3.6□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 YDR089WYDR089W 2610 nt3.59□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 EBS1YDR206W 2655 nt3.59□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 EPL1YFL024C 2499 nt3.59□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 YDR149CYDR149C 708 nt3.59□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 CGR1YGL029W 363 nt3.59□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt3.59□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 RPL24BYGR148C 468 nt3.59□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 RFA3YJL173C 369 nt3.59□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 RPL17AYKL180W 555 nt3.59□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 YKR070WYKR070W 1059 nt3.59□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 TRI1YMR233W 681 nt3.59□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 YNL226WYNL226W 411 nt3.59□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 PIN4YBL051C 2007 nt3.59□□□□□ -1.83
RIM20Q12033 PKP2YGL059W 1476 nt3.59□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 FAA2YER015W 2235 nt3.59□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 MIG1YGL035C 1515 nt3.59□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 SUC2YIL162W 1599 nt3.59□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 CAF130YGR134W 3369 nt3.59□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 FRE4YNR060W 2160 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 RRP42YDL111C 798 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 SRB7YDR308C 423 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 FRQ1YDR373W 573 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 ECM11YDR446W 909 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 APA2YDR530C 978 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 RPL22BYFL034C-A 369 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YGL204CYGL204C 306 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YGR107WYGR107W 450 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YHR097CYHR097C 1101 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YLR339CYLR339C 552 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 RHO5YNL180C 996 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 RAS1YOR101W 930 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 RPB8YOR224C 441 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 MRPS9YBR146W 837 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 STP1YDR463W 1560 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 HDA2YDR295C 2025 nt3.58□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YDL157CYDL157C 357 nt3.57□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YDL180WYDL180W 1644 nt3.57□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YEL010WYEL010W 351 nt3.57□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt3.57□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 RPC37YKR025W 849 nt3.57□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 SMD3YLR147C 306 nt3.57□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 SPH1YLR313C 1593 nt3.57□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 VIP1YLR410W 3441 nt3.57□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 WHI3YNL197C 1986 nt3.57□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YOR097CYOR097C 528 nt3.57□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 VPS17YOR132W 1656 nt3.57□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 RRP36YOR287C 903 nt3.57□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 HSE1YHL002W 1359 nt3.56□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 SPT2YER161C 1002 nt3.56□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 ERG25YGR060W 930 nt3.56□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt3.56□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 PEX15YOL044W 1152 nt3.56□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 GRX7YBR014C 612 nt3.56□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 HAT1YPL001W 1125 nt3.56□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 snR17asnR17a 333 nt3.56□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 CSR2YPR030W 3366 nt3.56□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 HEH2YDR458C 1992 nt3.56□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 BAR1YIL015W 1764 nt3.56□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 JJJ1YNL227C 1773 nt3.56□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 STE6YKL209C 3873 nt3.55□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 PET100YDR079W 336 nt3.55□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 ERG20YJL167W 1059 nt3.55□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 CCE1YKL011C 1062 nt3.55□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YKL131WYKL131W 522 nt3.55□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YAL066WYAL066W 309 nt3.55□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 COQ9YLR201C 783 nt3.55□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 SYT1YPR095C 3681 nt3.55□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 MSB2YGR014W 3921 nt3.55□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 GCD2YGR083C 1956 nt3.54□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 SLY41YOR307C 1362 nt3.54□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 SAD1YFR005C 1347 nt3.54□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 PPH3YDR075W 927 nt3.54□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 SCM4YGR049W 564 nt3.54□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 PDX1YGR193C 1233 nt3.54□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 TEM1YML064C 738 nt3.54□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 DLT1YMR126C 1029 nt3.54□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.54□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YBR116CYBR116C 528 nt3.54□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 AI4Q0065 1671 nt3.54□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 RNT1YMR239C 1416 nt3.53□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 SPT16YGL207W 3108 nt3.53□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 TOP1YOL006C 2310 nt3.53□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 COM2YER130C 1332 nt3.53□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YCR100CYCR100C 951 nt3.53□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YGL218WYGL218W 651 nt3.53□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 YMR087WYMR087W 855 nt3.53□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 CPA2YJR109C 3357 nt3.53□□□□□ -1.84
RIM20Q12033 STU1YBL034C 4542 nt3.53□□□□□ -1.84
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