Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 RPN4YDL020C 1596 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YPS6YIR039C 1614 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 ENA2YDR039C 3276 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 ENA1YDR040C 3276 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 STU1YBL034C 4542 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 IZH1YDR492W 951 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 RPL23BYER117W 414 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 RPL30YGL030W 318 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 TDA8YAL064C-A 381 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 PRE8YML092C 753 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 PEX11YOL147C 711 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YOR114WYOR114W 885 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 SFG1YOR315W 1041 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 MED8YBR193C 672 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 MIP6YHR015W 1980 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 ART10YLR392C 1557 nt3.08□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 CHS3YBR023C 3498 nt3.07□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YDL199CYDL199C 2064 nt3.07□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 REB1YBR049C 2433 nt3.07□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YPP1YGR198W 2454 nt3.07□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YGL177WYGL177W 348 nt3.07□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 DOG2YHR043C 741 nt3.07□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 CFD1YIL003W 882 nt3.07□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 RAD33YML011C 534 nt3.07□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 SPC2YML055W 537 nt3.07□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YNL303WYNL303W 348 nt3.07□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 TLC1TLC1 1301 nt3.07□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YNR066CYNR066C 1311 nt3.07□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 NUF2YOL069W 1356 nt3.07□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 ETP1YHL010C 1758 nt3.07□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 NHP10YDL002C 612 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 CLB3YDL155W 1284 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 DET1YDR051C 1005 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 ECM18YDR125C 1362 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 SPT15YER148W 723 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 RPL1BYGL135W 654 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 MSM1YGR171C 1728 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 DOG1YHR044C 741 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 PPX1YHR201C 1194 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 CAP2YIL034C 864 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 PCL7YIL050W 858 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 VTC4YJL012C 2166 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 MAK11YKL021C 1407 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 BOS1YLR078C 735 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YLR416CYLR416C 399 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 CSM3YMR048W 954 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 ATP25YMR098C 1839 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 GIS2YNL255C 462 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YOR097CYOR097C 528 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 ATG5YPL149W 885 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 RPL1AYPL220W 654 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 ARA1YBR149W 1035 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 PBP2YBR233W 1242 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 RRP5YMR229C 5190 nt3.06□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 ROG1YGL144C 2058 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 MON1YGL124C 1935 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 CET1YPL228W 1650 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 ARP4YJL081C 1470 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 STE24YJR117W 1362 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 CBS2YDR197W 1170 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YGR190CYGR190C 366 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 EPT1YHR123W 1176 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YML047W-AYML047W-A 366 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 FYV6YNL133C 522 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 RRP36YOR287C 903 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YOR331CYOR331C 558 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 MRPL27YBR282W 441 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 RPA190YOR341W 4995 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 NSP1YJL041W 2472 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 SMC3YJL074C 3693 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YJR030CYJR030C 2238 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 MAL12YGR292W 1755 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 KRI1YNL308C 1776 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 MAL32YBR299W 1755 nt3.05□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 RDS2YPL133C 1341 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YFL012WYFL012W 447 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 CGR1YGL029W 363 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YGR111WYGR111W 1203 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 THP2YHR167W 786 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 SNX4YJL036W 1272 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 RFA3YJL173C 369 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 MRP8YKL142W 660 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 RDN58-1RDN58-1 158 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 RDN58-2RDN58-2 158 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 PRM4YPL156C 855 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 snR189snR189 189 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 TMA108YIL137C 2841 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 FRE4YNR060W 2160 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YDL180WYDL180W 1644 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 EBS1YDR206W 2655 nt3.04□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 RNT1YMR239C 1416 nt3.03□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 BCH1YMR237W 2175 nt3.03□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 TAN1YGL232W 870 nt3.03□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 PRP18YGR006W 756 nt3.03□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt3.03□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 HTD2YHR067W 843 nt3.03□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 FIP1YJR093C 984 nt3.03□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 IME1YJR094C 1083 nt3.03□□□□□ -1.92
YPQ1Q12010 RPS21AYKR057W 264 nt3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.1 ms