Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMOD3Q0VAK6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LMOD3Q0VAK6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMOD3Q0VAK6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms