Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CD300CQ08708 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CD300CQ08708 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms