Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDE4DQ08499 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDE4DQ08499 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms