Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNG1Q06432 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CACNG1Q06432 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms