Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PSME1Q06323 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PSME1Q06323 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms