Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TNP2Q05952 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms