Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBE3AQ05086 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBE3AQ05086 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms