Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EMX2Q04743 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EMX2Q04743 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms