Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT17Q04695 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT17Q04695 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms