Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TAP1Q03518 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TAP1Q03518 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms