Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAV1Q03135 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAV1Q03135 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms