Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPL6Q02878 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms