Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRG1Q02297 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRG1Q02297 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms