Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BNC1Q01954 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms