Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CACNA1DQ01668 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CACNA1DQ01668 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms