Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TFAMQ00059 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFAMQ00059 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms