Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FAM3AP98173 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3AP98173 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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