Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SKOR1P84550 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SKOR1P84550 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms