Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX5P78411 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX5P78411 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX5P78411 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX5P78411 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX5P78411 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX5P78411 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX5P78411 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX5P78411 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX5P78411 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX5P78411 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRX5P78411 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRX5P78411 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX5P78411 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX5P78411 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX5P78411 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX5P78411 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX5P78411 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX5P78411 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX5P78411 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX5P78411 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX5P78411 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX5P78411 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRX5P78411 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX5P78411 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX5P78411 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX5P78411 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX5P78411 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX5P78411 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX5P78411 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX5P78411 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX5P78411 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX5P78411 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX5P78411 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX5P78411 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX5P78411 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX5P78411 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX5P78411 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRX5P78411 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX5P78411 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX5P78411 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX5P78411 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX5P78411 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX5P78411 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX5P78411 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX5P78411 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX5P78411 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX5P78411 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX5P78411 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX5P78411 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX5P78411 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX5P78411 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRX5P78411 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX5P78411 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IRX5P78411 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX5P78411 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX5P78411 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX5P78411 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IRX5P78411 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX5P78411 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX5P78411 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX5P78411 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX5P78411 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX5P78411 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX5P78411 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX5P78411 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX5P78411 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX5P78411 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX5P78411 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX5P78411 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX5P78411 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX5P78411 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IRX5P78411 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX5P78411 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX5P78411 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX5P78411 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX5P78411 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX5P78411 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IRX5P78411 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX5P78411 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX5P78411 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX5P78411 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX5P78411 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX5P78411 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX5P78411 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms