Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA1P78396 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNA1P78396 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA1P78396 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms