Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CSNK2A1P68400 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms