Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNRPNP63162 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNRPNP63162 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms