Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL30P62888 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL30P62888 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL30P62888 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL30P62888 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL30P62888 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL30P62888 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPL30P62888 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL30P62888 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL30P62888 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL30P62888 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL30P62888 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL30P62888 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL30P62888 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL30P62888 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL30P62888 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL30P62888 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL30P62888 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL30P62888 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL30P62888 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL30P62888 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPL30P62888 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPL30P62888 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL30P62888 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL30P62888 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL30P62888 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL30P62888 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL30P62888 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL30P62888 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL30P62888 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RPL30P62888 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL30P62888 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL30P62888 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL30P62888 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL30P62888 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL30P62888 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL30P62888 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL30P62888 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL30P62888 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RPL30P62888 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL30P62888 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL30P62888 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL30P62888 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL30P62888 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL30P62888 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL30P62888 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL30P62888 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL30P62888 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL30P62888 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RPL30P62888 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RPL30P62888 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL30P62888 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL30P62888 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL30P62888 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RPL30P62888 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms